Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYD88Q99836 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYD88Q99836 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms