Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRAMP1Q96RY5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms