Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CICQ96RK0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms