Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms