Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD8Q96LT4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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