Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRIQ1Q96JM4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRIQ1Q96JM4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
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