Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ABCC12Q96J65 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ABCC12Q96J65 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms