Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BORCS6Q96GS4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms