Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPTSSAQ969W0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPTSSAQ969W0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms