Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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TRIM63Q969Q1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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