Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCC1Q92922 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms