Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFT2D1Q8WV19 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms