Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX29Q8TEQ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms