Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC21AQ8NDW8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms