Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ZNF439Q8NDP4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF439Q8NDP4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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