Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00116Q8NCU8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00116Q8NCU8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms