Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ARRDC4Q8NCT1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms