Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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