Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DNAAF3Q8N9W5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms