Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC82Q8N4S0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC82Q8N4S0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms