Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SYNE4Q8N205 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms