Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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