Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT28Q7Z3Y7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT28Q7Z3Y7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms