Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE3BQ7Z3V4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE3BQ7Z3V4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms