Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG9AQ7Z3C6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG9AQ7Z3C6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms