Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APTXQ7Z2E3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APTXQ7Z2E3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms