Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP43Q70EL4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
USP43Q70EL4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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