Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF880Q6PDB4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF880Q6PDB4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms