Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCSD1Q6JBY9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCSD1Q6JBY9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms