Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATL3Q6DD88 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms