Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GARNL3Q5VVW2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms