Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms