Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GKAP1Q5VSY0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GKAP1Q5VSY0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms