Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HDGFL1Q5TGJ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDGFL1Q5TGJ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms