Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A3Q5K4L6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A3Q5K4L6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms