Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms