Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
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FOXD1Q16676 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
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FOXD1Q16676 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXD1Q16676 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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FOXD1Q16676 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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FOXD1Q16676 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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FOXD1Q16676 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
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FOXD1Q16676 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
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