Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC6Q16204 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC6Q16204 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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