Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS72Q15906 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VPS72Q15906 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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