Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN9AQ15858 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN9AQ15858 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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