Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDSNQ15517 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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