Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCAPHQ15003 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCAPHQ15003 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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