Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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GPNMBQ14956 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GPNMBQ14956 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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