Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDC1Q14676 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
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