Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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GTF2H3Q13889 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF2H3Q13889 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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