Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA7Q13683 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ITGA7Q13683 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ITGA7Q13683 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ITGA7Q13683 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ITGA7Q13683 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ITGA7Q13683 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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