Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PMS2P11Q13670 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms