Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NAE1Q13564 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NAE1Q13564 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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