Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEUROD1Q13562 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEUROD1Q13562 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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