Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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C1orf61Q13536 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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C1orf61Q13536 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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C1orf61Q13536 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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C1orf61Q13536 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C1orf61Q13536 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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